Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep3Q99KK1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms