Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn1Q99JR1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn1Q99JR1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn1Q99JR1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn1Q99JR1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn1Q99JR1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn1Q99JR1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn1Q99JR1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn1Q99JR1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn1Q99JR1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn1Q99JR1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn1Q99JR1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn1Q99JR1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn1Q99JR1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn1Q99JR1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn1Q99JR1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn1Q99JR1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn1Q99JR1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn1Q99JR1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn1Q99JR1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn1Q99JR1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn1Q99JR1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn1Q99JR1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfxn1Q99JR1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms