Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Ddb2Q99J79 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Ddb2Q99J79 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Ddb2Q99J79 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Ddb2Q99J79 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Ddb2Q99J79 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Ddb2Q99J79 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Ddb2Q99J79 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ddb2Q99J79 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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