Protein–RNA interactions for Protein: Q99J25

Mrm1, rRNA methyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrm1Q99J25 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrm1Q99J25 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms