Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Smim11aQ99J19 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Smim11aQ99J19 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Smim11aQ99J19 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Smim11aQ99J19 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Smim11aQ99J19 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Smim11aQ99J19 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Smim11aQ99J19 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Smim11aQ99J19 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim11aQ99J19 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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