Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn16Q925N4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Cldn16Q925N4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Cldn16Q925N4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Cldn16Q925N4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Cldn16Q925N4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Cldn16Q925N4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Cldn16Q925N4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Cldn16Q925N4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Cldn16Q925N4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Cldn16Q925N4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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