Protein–RNA interactions for Protein: Q925N1

Sfxn4, Sideroflexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn4Q925N1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sfxn4Q925N1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sfxn4Q925N1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sfxn4Q925N1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sfxn4Q925N1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sfxn4Q925N1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Sfxn4Q925N1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Sfxn4Q925N1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Sfxn4Q925N1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Sfxn4Q925N1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfxn4Q925N1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms