Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim7Q923T7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim7Q923T7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms