Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp3Q923K4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Gtpbp3Q923K4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Gtpbp3Q923K4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Gtpbp3Q923K4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Gtpbp3Q923K4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gtpbp3Q923K4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gtpbp3Q923K4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gtpbp3Q923K4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gtpbp3Q923K4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gtpbp3Q923K4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gtpbp3Q923K4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gtpbp3Q923K4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gtpbp3Q923K4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gtpbp3Q923K4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gtpbp3Q923K4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gtpbp3Q923K4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gtpbp3Q923K4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gtpbp3Q923K4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp3Q923K4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms