Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clip1Q922J3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms