Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf7Q922B6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf7Q922B6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms