Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY7

Pcdhga12, Protocadherin gamma A12, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga12Q91XY7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Pcdhga12Q91XY7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhga12Q91XY7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms