Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd3Q91W18 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tdrd3Q91W18 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms