Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mark1Q8VHJ5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mark1Q8VHJ5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mark1Q8VHJ5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mark1Q8VHJ5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mark1Q8VHJ5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms