Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ccdc71Q8VEG0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms