Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE62

Paip1, Polyadenylate-binding protein-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paip1Q8VE62 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Paip1Q8VE62 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Paip1Q8VE62 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Paip1Q8VE62 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Paip1Q8VE62 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Paip1Q8VE62 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Paip1Q8VE62 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Paip1Q8VE62 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Paip1Q8VE62 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Paip1Q8VE62 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Paip1Q8VE62 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Paip1Q8VE62 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Paip1Q8VE62 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Paip1Q8VE62 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Paip1Q8VE62 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Paip1Q8VE62 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Paip1Q8VE62 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Paip1Q8VE62 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Paip1Q8VE62 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Paip1Q8VE62 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Paip1Q8VE62 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Paip1Q8VE62 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Paip1Q8VE62 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Paip1Q8VE62 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Paip1Q8VE62 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms