Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fyco1Q8VDC1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fyco1Q8VDC1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fyco1Q8VDC1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fyco1Q8VDC1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fyco1Q8VDC1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Fyco1Q8VDC1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fyco1Q8VDC1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fyco1Q8VDC1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fyco1Q8VDC1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fyco1Q8VDC1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms