Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a20aQ8VDB9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms