Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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