Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med17Q8VCD5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med17Q8VCD5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms