Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW6

Nae1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nae1Q8VBW6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nae1Q8VBW6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms