Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim29Q8R2Q0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms