Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CipcQ8R0W1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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