Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Hecw1Q8K4P8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hecw1Q8K4P8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms