Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lin28aQ8K3Y3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lin28aQ8K3Y3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms