Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5rap2Q8K389 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms