Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2Q8K2Y9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms