Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl47Q8K2Y7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms