Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms