Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pacs1Q8K212 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacs1Q8K212 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacs1Q8K212 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacs1Q8K212 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacs1Q8K212 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacs1Q8K212 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms