Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sde2Q8K1J5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms