Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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FgbQ8K0E8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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FgbQ8K0E8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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FgbQ8K0E8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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FgbQ8K0E8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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FgbQ8K0E8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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FgbQ8K0E8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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FgbQ8K0E8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FgbQ8K0E8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms