Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms