Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ep400Q8CHI8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms