Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Hpf1Q8CFE2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Hpf1Q8CFE2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Hpf1Q8CFE2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Hpf1Q8CFE2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hpf1Q8CFE2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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