Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms