Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RybpQ8CCI5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms