Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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