Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ephb1Q8CBF3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ephb1Q8CBF3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ephb1Q8CBF3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms