Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dclre1bQ8C7W7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms