Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc113Q8C5T8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc113Q8C5T8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc113Q8C5T8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc113Q8C5T8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Ccdc113Q8C5T8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Ccdc113Q8C5T8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Ccdc113Q8C5T8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Ccdc113Q8C5T8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Ccdc113Q8C5T8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Ccdc113Q8C5T8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Ccdc113Q8C5T8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Ccdc113Q8C5T8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Ccdc113Q8C5T8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Ccdc113Q8C5T8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Ccdc113Q8C5T8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc113Q8C5T8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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