Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfrp1Q8C4U3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms