Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms