Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY89

Slc44a2, Choline transporter-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a2Q8BY89 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms