Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sall4Q8BX22 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms