Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ctdsp2Q8BX07 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ctdsp2Q8BX07 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ctdsp2Q8BX07 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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