Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcl3Q8BVF2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms