Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rccd1Q8BTU7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rccd1Q8BTU7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms