Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms