Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp54Q8BL06 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms